Protein–RNA interactions for Protein: O76038

SCGN, Secretagogin, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGNO76038 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCGNO76038 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCGNO76038 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCGNO76038 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCGNO76038 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCGNO76038 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCGNO76038 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCGNO76038 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCGNO76038 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCGNO76038 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCGNO76038 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCGNO76038 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGNO76038 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGNO76038 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGNO76038 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGNO76038 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCGNO76038 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCGNO76038 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCGNO76038 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCGNO76038 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCGNO76038 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGNO76038 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGNO76038 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGNO76038 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCGNO76038 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCGNO76038 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCGNO76038 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCGNO76038 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGNO76038 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGNO76038 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGNO76038 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGNO76038 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGNO76038 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGNO76038 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGNO76038 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGNO76038 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGNO76038 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGNO76038 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGNO76038 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCGNO76038 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGNO76038 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGNO76038 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGNO76038 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGNO76038 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGNO76038 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCGNO76038 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCGNO76038 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCGNO76038 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCGNO76038 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGNO76038 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGNO76038 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGNO76038 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGNO76038 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGNO76038 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCGNO76038 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCGNO76038 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCGNO76038 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCGNO76038 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCGNO76038 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCGNO76038 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGNO76038 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGNO76038 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGNO76038 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGNO76038 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCGNO76038 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGNO76038 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGNO76038 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGNO76038 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCGNO76038 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCGNO76038 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCGNO76038 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCGNO76038 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGNO76038 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGNO76038 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGNO76038 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGNO76038 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGNO76038 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGNO76038 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGNO76038 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGNO76038 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCGNO76038 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGNO76038 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGNO76038 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGNO76038 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGNO76038 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGNO76038 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGNO76038 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGNO76038 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGNO76038 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGNO76038 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGNO76038 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGNO76038 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGNO76038 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGNO76038 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGNO76038 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGNO76038 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCGNO76038 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCGNO76038 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGNO76038 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGNO76038 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms