Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMUO75648 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMUO75648 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMUO75648 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMUO75648 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMUO75648 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMUO75648 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMUO75648 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMUO75648 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMUO75648 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMUO75648 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMUO75648 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMUO75648 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMUO75648 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMUO75648 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMUO75648 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMUO75648 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMUO75648 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMUO75648 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMUO75648 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMUO75648 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMUO75648 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMUO75648 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMUO75648 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMUO75648 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMUO75648 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMUO75648 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMUO75648 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMUO75648 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMUO75648 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMUO75648 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMUO75648 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMUO75648 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMUO75648 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMUO75648 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMUO75648 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMUO75648 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMUO75648 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMUO75648 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMUO75648 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMUO75648 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMUO75648 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMUO75648 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMUO75648 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMUO75648 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMUO75648 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMUO75648 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMUO75648 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMUO75648 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMUO75648 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMUO75648 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMUO75648 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMUO75648 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMUO75648 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMUO75648 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMUO75648 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMUO75648 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMUO75648 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMUO75648 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMUO75648 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMUO75648 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMUO75648 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMUO75648 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMUO75648 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMUO75648 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMUO75648 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMUO75648 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRMUO75648 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRMUO75648 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMUO75648 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMUO75648 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMUO75648 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMUO75648 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMUO75648 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMUO75648 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMUO75648 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMUO75648 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMUO75648 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMUO75648 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMUO75648 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMUO75648 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMUO75648 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMUO75648 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMUO75648 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMUO75648 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMUO75648 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMUO75648 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMUO75648 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMUO75648 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMUO75648 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMUO75648 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMUO75648 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMUO75648 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMUO75648 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMUO75648 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMUO75648 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMUO75648 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMUO75648 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMUO75648 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMUO75648 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms