Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F6O75461 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F6O75461 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F6O75461 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F6O75461 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F6O75461 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F6O75461 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F6O75461 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F6O75461 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F6O75461 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F6O75461 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F6O75461 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F6O75461 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F6O75461 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F6O75461 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F6O75461 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F6O75461 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F6O75461 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F6O75461 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F6O75461 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F6O75461 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F6O75461 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F6O75461 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F6O75461 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F6O75461 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F6O75461 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F6O75461 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F6O75461 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F6O75461 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F6O75461 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F6O75461 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F6O75461 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F6O75461 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F6O75461 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F6O75461 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F6O75461 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F6O75461 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F6O75461 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F6O75461 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F6O75461 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F6O75461 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F6O75461 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F6O75461 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F6O75461 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F6O75461 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F6O75461 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F6O75461 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F6O75461 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F6O75461 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F6O75461 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F6O75461 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F6O75461 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F6O75461 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F6O75461 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F6O75461 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F6O75461 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F6O75461 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F6O75461 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F6O75461 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F6O75461 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F6O75461 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F6O75461 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F6O75461 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F6O75461 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F6O75461 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F6O75461 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F6O75461 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F6O75461 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F6O75461 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F6O75461 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F6O75461 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F6O75461 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F6O75461 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F6O75461 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F6O75461 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F6O75461 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F6O75461 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F6O75461 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F6O75461 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F6O75461 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F6O75461 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F6O75461 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F6O75461 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F6O75461 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F6O75461 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F6O75461 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F6O75461 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F6O75461 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F6O75461 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F6O75461 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F6O75461 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F6O75461 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F6O75461 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F6O75461 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F6O75461 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F6O75461 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F6O75461 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F6O75461 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F6O75461 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F6O75461 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms