Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD2O60548 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD2O60548 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD2O60548 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD2O60548 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD2O60548 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD2O60548 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD2O60548 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms