Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
VGFO15240 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
VGFO15240 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
VGFO15240 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
VGFO15240 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
VGFO15240 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
VGFO15240 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
VGFO15240 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
VGFO15240 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
VGFO15240 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
VGFO15240 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
VGFO15240 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
VGFO15240 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
VGFO15240 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
VGFO15240 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
VGFO15240 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
VGFO15240 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
VGFO15240 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
VGFO15240 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
VGFO15240 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
VGFO15240 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
VGFO15240 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
VGFO15240 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
VGFO15240 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
VGFO15240 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
VGFO15240 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
VGFO15240 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
VGFO15240 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
VGFO15240 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
VGFO15240 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
VGFO15240 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
VGFO15240 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
VGFO15240 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
VGFO15240 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VGFO15240 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
VGFO15240 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
VGFO15240 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
VGFO15240 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
VGFO15240 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
VGFO15240 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
VGFO15240 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
VGFO15240 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
VGFO15240 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
VGFO15240 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
VGFO15240 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
VGFO15240 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
VGFO15240 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
VGFO15240 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
VGFO15240 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
VGFO15240 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
VGFO15240 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
VGFO15240 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
VGFO15240 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.72
VGFO15240 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
VGFO15240 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
VGFO15240 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
VGFO15240 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
VGFO15240 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
VGFO15240 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
VGFO15240 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
VGFO15240 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
VGFO15240 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
VGFO15240 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
VGFO15240 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
VGFO15240 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.26■■■■□ 3.72
VGFO15240 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
VGFO15240 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
VGFO15240 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
VGFO15240 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
VGFO15240 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
VGFO15240 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
VGFO15240 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
VGFO15240 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
VGFO15240 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
VGFO15240 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
VGFO15240 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
VGFO15240 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
VGFO15240 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
VGFO15240 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
VGFO15240 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
VGFO15240 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
VGFO15240 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
VGFO15240 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
VGFO15240 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
VGFO15240 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
VGFO15240 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
VGFO15240 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
VGFO15240 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
VGFO15240 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
VGFO15240 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
VGFO15240 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
VGFO15240 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
VGFO15240 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
VGFO15240 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
VGFO15240 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
VGFO15240 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
VGFO15240 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
VGFO15240 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
VGFO15240 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
VGFO15240 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms