Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1CO15160 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1CO15160 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1CO15160 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR1CO15160 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1CO15160 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1CO15160 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms