Protein–RNA interactions for Protein: O15067

PFAS, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFASO15067 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PFASO15067 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PFASO15067 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PFASO15067 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PFASO15067 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PFASO15067 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PFASO15067 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PFASO15067 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PFASO15067 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PFASO15067 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PFASO15067 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PFASO15067 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PFASO15067 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PFASO15067 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PFASO15067 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PFASO15067 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PFASO15067 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PFASO15067 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PFASO15067 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PFASO15067 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PFASO15067 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PFASO15067 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PFASO15067 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PFASO15067 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PFASO15067 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PFASO15067 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PFASO15067 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PFASO15067 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PFASO15067 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PFASO15067 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PFASO15067 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PFASO15067 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PFASO15067 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PFASO15067 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PFASO15067 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PFASO15067 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PFASO15067 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PFASO15067 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PFASO15067 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PFASO15067 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PFASO15067 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PFASO15067 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PFASO15067 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PFASO15067 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PFASO15067 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PFASO15067 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PFASO15067 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PFASO15067 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PFASO15067 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PFASO15067 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PFASO15067 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PFASO15067 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PFASO15067 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PFASO15067 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PFASO15067 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PFASO15067 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PFASO15067 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PFASO15067 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PFASO15067 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PFASO15067 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PFASO15067 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PFASO15067 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PFASO15067 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PFASO15067 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PFASO15067 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PFASO15067 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PFASO15067 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PFASO15067 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PFASO15067 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PFASO15067 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PFASO15067 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PFASO15067 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PFASO15067 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PFASO15067 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PFASO15067 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PFASO15067 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PFASO15067 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PFASO15067 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PFASO15067 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PFASO15067 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PFASO15067 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PFASO15067 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PFASO15067 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PFASO15067 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PFASO15067 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PFASO15067 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PFASO15067 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PFASO15067 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PFASO15067 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PFASO15067 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PFASO15067 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PFASO15067 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PFASO15067 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PFASO15067 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PFASO15067 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PFASO15067 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PFASO15067 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PFASO15067 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PFASO15067 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PFASO15067 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms