Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FFAR3O14843 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FFAR3O14843 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FFAR3O14843 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FFAR3O14843 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FFAR3O14843 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FFAR3O14843 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FFAR3O14843 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FFAR3O14843 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FFAR3O14843 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms