Protein–RNA interactions for Protein: O14737

PDCD5, Programmed cell death protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD5O14737 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCD5O14737 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCD5O14737 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD5O14737 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCD5O14737 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD5O14737 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD5O14737 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD5O14737 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms