Protein–RNA interactions for Protein: O14519

CDK2AP1, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP1O14519 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK2AP1O14519 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK2AP1O14519 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK2AP1O14519 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK2AP1O14519 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK2AP1O14519 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK2AP1O14519 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms