Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DLL1O00548 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DLL1O00548 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DLL1O00548 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DLL1O00548 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DLL1O00548 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DLL1O00548 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DLL1O00548 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DLL1O00548 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DLL1O00548 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DLL1O00548 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DLL1O00548 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DLL1O00548 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DLL1O00548 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DLL1O00548 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DLL1O00548 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DLL1O00548 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DLL1O00548 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DLL1O00548 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DLL1O00548 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DLL1O00548 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DLL1O00548 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DLL1O00548 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DLL1O00548 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DLL1O00548 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DLL1O00548 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DLL1O00548 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DLL1O00548 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DLL1O00548 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DLL1O00548 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DLL1O00548 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DLL1O00548 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DLL1O00548 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DLL1O00548 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DLL1O00548 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DLL1O00548 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DLL1O00548 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DLL1O00548 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DLL1O00548 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DLL1O00548 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DLL1O00548 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DLL1O00548 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DLL1O00548 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DLL1O00548 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DLL1O00548 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DLL1O00548 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DLL1O00548 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DLL1O00548 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DLL1O00548 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DLL1O00548 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DLL1O00548 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DLL1O00548 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DLL1O00548 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DLL1O00548 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DLL1O00548 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DLL1O00548 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DLL1O00548 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DLL1O00548 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DLL1O00548 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DLL1O00548 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DLL1O00548 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DLL1O00548 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DLL1O00548 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DLL1O00548 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DLL1O00548 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DLL1O00548 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DLL1O00548 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DLL1O00548 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DLL1O00548 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DLL1O00548 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DLL1O00548 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DLL1O00548 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DLL1O00548 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DLL1O00548 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DLL1O00548 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DLL1O00548 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DLL1O00548 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DLL1O00548 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DLL1O00548 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DLL1O00548 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DLL1O00548 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms