Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GFRA2O00451 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GFRA2O00451 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GFRA2O00451 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GFRA2O00451 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GFRA2O00451 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GFRA2O00451 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GFRA2O00451 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GFRA2O00451 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GFRA2O00451 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GFRA2O00451 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GFRA2O00451 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GFRA2O00451 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GFRA2O00451 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GFRA2O00451 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GFRA2O00451 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GFRA2O00451 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GFRA2O00451 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms