Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC28A1O00337 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC28A1O00337 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC28A1O00337 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A1O00337 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC28A1O00337 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A1O00337 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A1O00337 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms