Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGRPO00253 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGRPO00253 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGRPO00253 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGRPO00253 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGRPO00253 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGRPO00253 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGRPO00253 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGRPO00253 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AGRPO00253 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGRPO00253 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGRPO00253 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGRPO00253 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGRPO00253 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGRPO00253 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGRPO00253 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGRPO00253 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGRPO00253 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGRPO00253 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGRPO00253 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGRPO00253 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGRPO00253 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGRPO00253 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGRPO00253 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGRPO00253 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AGRPO00253 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGRPO00253 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AGRPO00253 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGRPO00253 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGRPO00253 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGRPO00253 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGRPO00253 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGRPO00253 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGRPO00253 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGRPO00253 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGRPO00253 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGRPO00253 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGRPO00253 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGRPO00253 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGRPO00253 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGRPO00253 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGRPO00253 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGRPO00253 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGRPO00253 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGRPO00253 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGRPO00253 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGRPO00253 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGRPO00253 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGRPO00253 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGRPO00253 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGRPO00253 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGRPO00253 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGRPO00253 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGRPO00253 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGRPO00253 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGRPO00253 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGRPO00253 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGRPO00253 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AGRPO00253 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGRPO00253 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGRPO00253 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGRPO00253 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGRPO00253 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGRPO00253 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGRPO00253 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGRPO00253 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGRPO00253 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGRPO00253 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGRPO00253 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGRPO00253 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGRPO00253 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AGRPO00253 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGRPO00253 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGRPO00253 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGRPO00253 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGRPO00253 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGRPO00253 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGRPO00253 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGRPO00253 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGRPO00253 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGRPO00253 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGRPO00253 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGRPO00253 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGRPO00253 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGRPO00253 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AGRPO00253 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGRPO00253 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGRPO00253 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGRPO00253 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGRPO00253 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGRPO00253 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGRPO00253 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
AGRPO00253 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGRPO00253 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGRPO00253 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGRPO00253 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGRPO00253 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGRPO00253 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGRPO00253 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGRPO00253 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms