Protein–RNA interactions for Protein: K7EN88

hCG_2039718, HCG2039718, isoform CRA_g, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_2039718K7EN88 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
hCG_2039718K7EN88 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
hCG_2039718K7EN88 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
hCG_2039718K7EN88 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
hCG_2039718K7EN88 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
hCG_2039718K7EN88 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
hCG_2039718K7EN88 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms