Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEDD8-MDP1E9PL57 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEDD8-MDP1E9PL57 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms