Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
B4DLN1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
B4DLN1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
B4DLN1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
B4DLN1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
B4DLN1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
B4DLN1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
B4DLN1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
B4DLN1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
B4DLN1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
B4DLN1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
B4DLN1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
B4DLN1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
B4DLN1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
B4DLN1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
B4DLN1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
B4DLN1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
B4DLN1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
B4DLN1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
B4DLN1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
B4DLN1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
B4DLN1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
B4DLN1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
B4DLN1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
B4DLN1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
B4DLN1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
B4DLN1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
B4DLN1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
B4DLN1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
B4DLN1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
B4DLN1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
B4DLN1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
B4DLN1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
B4DLN1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
B4DLN1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
B4DLN1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
B4DLN1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
B4DLN1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
B4DLN1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
B4DLN1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
B4DLN1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
B4DLN1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
B4DLN1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
B4DLN1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
B4DLN1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
B4DLN1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
B4DLN1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
B4DLN1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
B4DLN1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
B4DLN1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
B4DLN1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
B4DLN1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
B4DLN1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
B4DLN1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
B4DLN1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
B4DLN1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
B4DLN1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
B4DLN1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
B4DLN1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
B4DLN1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
B4DLN1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
B4DLN1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
B4DLN1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
B4DLN1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
B4DLN1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
B4DLN1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
B4DLN1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
B4DLN1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
B4DLN1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
B4DLN1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
B4DLN1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
B4DLN1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
B4DLN1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
B4DLN1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
B4DLN1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
B4DLN1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
B4DLN1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
B4DLN1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
B4DLN1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
B4DLN1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
B4DLN1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
B4DLN1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
B4DLN1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
B4DLN1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
B4DLN1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
B4DLN1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
B4DLN1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
B4DLN1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
B4DLN1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
B4DLN1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
B4DLN1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
B4DLN1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
B4DLN1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
B4DLN1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
B4DLN1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
B4DLN1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
B4DLN1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
B4DLN1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
B4DLN1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
B4DLN1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms