Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
FER1L4A9Z1Z3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
FER1L4A9Z1Z3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
FER1L4A9Z1Z3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
FER1L4A9Z1Z3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
FER1L4A9Z1Z3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
FER1L4A9Z1Z3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FER1L4A9Z1Z3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FER1L4A9Z1Z3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
FER1L4A9Z1Z3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
FER1L4A9Z1Z3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
FER1L4A9Z1Z3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
FER1L4A9Z1Z3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
FER1L4A9Z1Z3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
FER1L4A9Z1Z3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
FER1L4A9Z1Z3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
FER1L4A9Z1Z3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
FER1L4A9Z1Z3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
FER1L4A9Z1Z3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.06
FER1L4A9Z1Z3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
FER1L4A9Z1Z3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
FER1L4A9Z1Z3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
FER1L4A9Z1Z3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
FER1L4A9Z1Z3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
FER1L4A9Z1Z3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FER1L4A9Z1Z3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
FER1L4A9Z1Z3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
FER1L4A9Z1Z3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
FER1L4A9Z1Z3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
FER1L4A9Z1Z3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
FER1L4A9Z1Z3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
FER1L4A9Z1Z3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
FER1L4A9Z1Z3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
FER1L4A9Z1Z3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
FER1L4A9Z1Z3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
FER1L4A9Z1Z3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
FER1L4A9Z1Z3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
FER1L4A9Z1Z3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
FER1L4A9Z1Z3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
FER1L4A9Z1Z3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
FER1L4A9Z1Z3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
FER1L4A9Z1Z3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
FER1L4A9Z1Z3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
FER1L4A9Z1Z3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FER1L4A9Z1Z3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FER1L4A9Z1Z3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FER1L4A9Z1Z3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FER1L4A9Z1Z3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
FER1L4A9Z1Z3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
FER1L4A9Z1Z3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
FER1L4A9Z1Z3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms