Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMTNL1A8MU46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMTNL1A8MU46 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMTNL1A8MU46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMTNL1A8MU46 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMTNL1A8MU46 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMTNL1A8MU46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMTNL1A8MU46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMTNL1A8MU46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms