Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
C5orf60A6NFR6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C5orf60A6NFR6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C5orf60A6NFR6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C5orf60A6NFR6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C5orf60A6NFR6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C5orf60A6NFR6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C5orf60A6NFR6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C5orf60A6NFR6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms