Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEGF11A6BM72 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEGF11A6BM72 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEGF11A6BM72 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MEGF11A6BM72 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEGF11A6BM72 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEGF11A6BM72 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MEGF11A6BM72 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEGF11A6BM72 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEGF11A6BM72 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEGF11A6BM72 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEGF11A6BM72 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MEGF11A6BM72 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEGF11A6BM72 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms