Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ88

Pnpla7, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla7A2AJ88 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pnpla7A2AJ88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pnpla7A2AJ88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pnpla7A2AJ88 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pnpla7A2AJ88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pnpla7A2AJ88 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pnpla7A2AJ88 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pnpla7A2AJ88 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pnpla7A2AJ88 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pnpla7A2AJ88 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Pnpla7A2AJ88 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pnpla7A2AJ88 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pnpla7A2AJ88 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Pnpla7A2AJ88 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pnpla7A2AJ88 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pnpla7A2AJ88 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pnpla7A2AJ88 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pnpla7A2AJ88 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Pnpla7A2AJ88 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pnpla7A2AJ88 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pnpla7A2AJ88 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pnpla7A2AJ88 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pnpla7A2AJ88 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pnpla7A2AJ88 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pnpla7A2AJ88 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pnpla7A2AJ88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pnpla7A2AJ88 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pnpla7A2AJ88 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Pnpla7A2AJ88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pnpla7A2AJ88 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pnpla7A2AJ88 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Pnpla7A2AJ88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Pnpla7A2AJ88 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pnpla7A2AJ88 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pnpla7A2AJ88 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pnpla7A2AJ88 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pnpla7A2AJ88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pnpla7A2AJ88 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pnpla7A2AJ88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pnpla7A2AJ88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms