Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQU2

KANTR, KDM5C adjacent transcript, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANTRA0A1W2PQU2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KANTRA0A1W2PQU2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANTRA0A1W2PQU2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KANTRA0A1W2PQU2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KANTRA0A1W2PQU2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KANTRA0A1W2PQU2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KANTRA0A1W2PQU2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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