Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPVL1A0A0U1RR11 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPVL1A0A0U1RR11 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPVL1A0A0U1RR11 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPVL1A0A0U1RR11 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPVL1A0A0U1RR11 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPVL1A0A0U1RR11 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms