Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A0U1RQJ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A0U1RQJ8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
A0A0U1RQJ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
A0A0U1RQJ8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0U1RQJ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
A0A0U1RQJ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A0U1RQJ8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
A0A0U1RQJ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
A0A0U1RQJ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
A0A0U1RQJ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
A0A0U1RQJ8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A0U1RQJ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A0U1RQJ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A0U1RQJ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
A0A0U1RQJ8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
A0A0U1RQJ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A0U1RQJ8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A0U1RQJ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A0U1RQJ8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms