Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 MYB-214ENST00000525477 3431 ntTSL 1 (best)18.78■□□□□ 0.61e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-237ENST00000533837 3492 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.451e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-210ENST00000463282 3422 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.421e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-204ENST00000367812 3565 ntTSL 1 (best)17.59■□□□□ 0.411e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 FOXK2-205ENST00000529652 2199 ntTSL 217.52■□□□□ 0.41e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-211ENST00000497906 495 ntTSL 516.89■□□□□ 0.291e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-202ENST00000461073 1157 ntTSL 216.19■□□□□ 0.181e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-208ENST00000481776 598 ntTSL 516.08■□□□□ 0.161e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 FOXK2-209ENST00000571989 573 ntTSL 515.15■□□□□ 0.021e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-206ENST00000468503 157 ntTSL 314.28□□□□□ -0.121e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 FOXK2-212ENST00000624186 4244 nt13.8□□□□□ -0.21e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-212ENST00000488648 720 ntTSL 513.29□□□□□ -0.281e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 COX7C-204ENST00000510447 581 ntTSL 311.48□□□□□ -0.571e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 ARID2-204ENST00000427628 323 ntTSL 510.1□□□□□ -0.791e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RAD23B-204ENST00000442587 456 ntTSL 28.96□□□□□ -0.981e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-232ENST00000531737 2436 ntTSL 1 (best)8.87□□□□□ -0.991e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-216ENST00000525940 1838 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.041e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-231ENST00000531634 1824 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.041e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.151e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-236ENST00000533808 3349 ntTSL 1 (best)7.62□□□□□ -1.191e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-234ENST00000533384 2521 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.21e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-227ENST00000529262 2427 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.21e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-225ENST00000528345 1973 ntTSL 1 (best)7.55□□□□□ -1.21e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-219ENST00000526565 2399 ntTSL 1 (best)7.26□□□□□ -1.251e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-218ENST00000526320 3081 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.281e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-212ENST00000525002 2182 ntTSL 1 (best)6.52□□□□□ -1.371e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-217ENST00000526187 2192 ntTSL 1 (best)6.52□□□□□ -1.371e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-233ENST00000531845 3230 ntTSL 26.4□□□□□ -1.391e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.41e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-223ENST00000528140 2021 ntTSL 1 (best)6.16□□□□□ -1.421e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.431e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.441e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-229ENST00000529586 3203 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.451e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-211ENST00000524588 1630 ntTSL 1 (best)5.97□□□□□ -1.451e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-224ENST00000528343 2091 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.471e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.491e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-215ENST00000525514 3288 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.491e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.491e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-230ENST00000531519 2911 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.521e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-222ENST00000528015 2201 ntTSL 1 (best)5.39□□□□□ -1.551e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-208ENST00000438901 3481 ntTSL 1 (best)4.96□□□□□ -1.621e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MYB-220ENST00000526889 3157 ntTSL 1 (best)4.92□□□□□ -1.621e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 XIAP-204ENST00000430625 528 ntTSL 34.92□□□□□ -1.621e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 ASXL1-205ENST00000497249 296 ntTSL 54.23□□□□□ -1.731e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.641e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-9■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 214.38□□□□□ -0.112e-9■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-9■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-206ENST00000550479 698 ntTSL 28.06□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.931e-323■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RPS3-208ENST00000527273 390 ntTSL 312.3□□□□□ -0.443e-7■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.086e-10■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.985e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 TRIP6-206ENST00000476870 1750 ntTSL 220.13■□□□□ 0.815e-8■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.85■□□□□ 0.617e-7■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 KIF2C-207ENST00000480574 783 ntTSL 511.9□□□□□ -0.57e-7■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 CDC27-212ENST00000570818 656 ntTSL 511.85□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 LRP8-208ENST00000475501 721 ntTSL 39.51□□□□□ -0.897e-7■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 ANGEL2-203ENST00000460337 1243 ntTSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.987e-7■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 SAFB-212ENST00000592396 620 ntTSL 46.35□□□□□ -1.393e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.011e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 57.01□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.883e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 220.05■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.015e-7■■■■□ 24.6
UTP3Q9NQZ2 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.515e-7■■■■□ 24.6
UTP3Q9NQZ2 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.835e-7■■■■□ 24.6
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-209ENST00000608368 551 ntTSL 415.32■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 24.6
UTP3Q9NQZ2 USP48-207ENST00000471752 445 ntTSL 38.67□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 24.6
UTP3Q9NQZ2 DHX15-202ENST00000503562 727 ntTSL 27.46□□□□□ -1.229e-9■■■■□ 24.6
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-207ENST00000479207 1112 ntTSL 312.2□□□□□ -0.465e-6■■■■□ 24.5
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-206ENST00000478389 3581 ntTSL 29.86□□□□□ -0.835e-6■■■■□ 24.5
UTP3Q9NQZ2 PKM-214ENST00000565143 2301 ntTSL 1 (best)13.7□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 24.5
UTP3Q9NQZ2 COPG1-207ENST00000513410 545 ntTSL 214.43□□□□□ -0.11e-12■■■■□ 24.5
UTP3Q9NQZ2 ARID3A-204ENST00000585895 377 ntTSL 227.95■■■□□ 2.069e-7■■■■□ 24.5
UTP3Q9NQZ2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.536e-8■■■■□ 24.5
UTP3Q9NQZ2 KMT2E-203ENST00000334884 6840 ntTSL 518.16■□□□□ 0.56e-8■■■■□ 24.5
UTP3Q9NQZ2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.476e-8■■■■□ 24.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 29.23□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 520.13■□□□□ 0.815e-18■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 320.1■□□□□ 0.815e-18■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.325e-18■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5B-202ENST00000547250 840 ntTSL 59.94□□□□□ -0.825e-18■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 36.73□□□□□ -1.335e-18■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 FBXO18-208ENST00000470089 979 ntTSL 531.32■■■□□ 2.66e-8■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 FBXO18-206ENST00000462507 906 ntTSL 213.02□□□□□ -0.336e-8■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 318.38■□□□□ 0.533e-8■■■■□ 24.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3495.2 ms