Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
V9GYQ6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
V9GYQ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
V9GYQ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
V9GYQ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
V9GYQ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
V9GYQ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V9GYQ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V9GYQ6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V9GYQ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms