Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA3Q9Y6H8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA3Q9Y6H8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms