Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00312Q9Y6C7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms