Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB6Q9Y5E3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB6Q9Y5E3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms