Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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NFE2L3Q9Y4A8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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NFE2L3Q9Y4A8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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