Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP11Q9Y3A2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms