Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms