Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINS2Q9Y248 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS2Q9Y248 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms