Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
INO80Q9ULG1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms