Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA3Q9UL41 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA3Q9UL41 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms