Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMFRQ9UKV5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms