Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms