Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ADAM28Q9UKQ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms