Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GGA1Q9UJY5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GGA1Q9UJY5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA1Q9UJY5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms