Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX41Q9UJV9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms