Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms