Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
OPN4Q9UHM6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms