Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms