Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RIMBP3Q9UFD9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMBP3Q9UFD9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms