Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM10Q9UDY6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM10Q9UDY6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms