Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGSF9Q9P2J2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9Q9P2J2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms