Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms