Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM5Q9P217 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZSWIM5Q9P217 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZSWIM5Q9P217 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZSWIM5Q9P217 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZSWIM5Q9P217 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms