Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HCN3Q9P1Z3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HCN3Q9P1Z3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms